RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 ALDH1B1P30837 517 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 C1QTNF8P60827 252 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 NLRP10Q86W26 655 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR63Q8IWG1 891 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.22■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 PRELPP51888 382 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC93Q567U6 631 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 TSPYL6Q8N831 410 aa22.2■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 GOLGA2Q08379 1002 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 NLRP3Q96P20 1036 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 KIF3CO14782 793 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 STK31Q9BXU1 1019 aa22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 LAMB2P55268 1798 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 CACNA1FO60840 1977 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 GLTPD2A6NH11 291 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 SNED1Q8TER0 1413 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 OLFM4Q6UX06 510 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 SYNE4Q8N205 404 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.12■■□□□ 1.13
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ANKRD54-208ENST00000458278 PSMD1Q99460 953 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 TOMM70O94826 608 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM89AQ96GI7 184 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 CCER2I3L3R5 266 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 KSR2Q6VAB6 950 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 MYD88Q99836 296 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 ABCC4O15439 1325 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF521Q96K83 1311 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 VAMP4O75379 141 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 BBOX1O75936 387 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC4A2P04920 1241 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 RRAGCQ9HB90 399 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR90Q96KV7 1748 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 GRAPQ13588 217 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 TMC4Q7Z404 712 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF428Q96B54 188 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 FLIIQ13045 1269 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 G2E3Q7L622 706 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 SP8Q8IXZ3 490 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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