RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-215	ENST00000447232	VEGFB	P49765	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232		A0A0G2JLW4	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	POTEC	B2RU33	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	NR1I2	O75469	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	S1PR4	O95977	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	XP32	Q5T750	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	NFAT5	O94916	1531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	KCNA3	P22001	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	ADH1B	P00325	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	DPEP1	P16444	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	SLC19A1	P41440	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMS1-215	ENST00000447232	USP47	Q96K76	1375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	FUT2	Q10981	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	MMP10	P09238	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	GCGR	P47871	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	MORN1	Q5T089	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SPRYD7	Q5W111	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SPSB2	Q99619	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SSFA2	P28290	1259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SULF1	Q8IWU6	871 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	IRF6	O14896	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	ITGAE	P38570	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	AK7	Q96M32	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	DLL1	O00548	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	LMNB1	P20700	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	RASSF7	Q02833	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	LTN1	O94822	1766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	SOX10	P56693	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	GDF9	O60383	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	CD46	P15529	392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PRR20E	P86478	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PRR20C	P86479	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PRR20D	P86480	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PRR20B	P86481	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	PRR20A	P86496	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PMS1-215	ENST00000447232	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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