RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC183Q5T5S1 534 aa17.13■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SRGAP3O43295 1099 aa17.13■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 VPS72Q15906 364 aa17.13■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 VPS53Q5VIR6 699 aa17.13■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SNRKQ9NRH2 765 aa17.13■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SCN11AQ9UI33 1791 aa17.12■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 HEG1Q9ULI3 1381 aa17.12■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 IL2RBP14784 551 aa17.12■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 UBE2HP62256 183 aa17.12■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 TSHZ3Q63HK5 1081 aa17.12■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 PDCL3Q9H2J4 239 aa17.11■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 USP48Q86UV5 1035 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SPG7Q9UQ90 795 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 UTYO14607 1347 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 EVI5LQ96CN4 794 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 ECHDC1Q9NTX5 307 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 ADCY9O60503 1353 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 DISP2A7MBM2 1401 aa17.09■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 STX6O43752 255 aa17.09■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.09■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 GLI3P10071 1580 aa17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 TEFQ10587 303 aa17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 KAT6BQ8WYB5 2073 aa17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 SMC3Q9UQE7 1217 aa17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 CYP27B1O15528 508 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 F13A1P00488 732 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 AK2P54819 239 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 KSR2Q6VAB6 950 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 LGR6Q9HBX8 967 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 HYPKQ9NX55 129 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PHKG2P15735 406 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 RUFY3Q7L099 469 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 NECTIN2Q92692 538 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 IL25Q9H293 177 aa17.07■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 TPM3P06753 285 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 SYT1P21579 422 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 TICAM2Q86XR7 235 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 BTBD11A6QL63 1104 aa17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 DYNC1I1O14576 645 aa17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PSMA5P28066 241 aa17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 ANKRD1Q15327 319 aa17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 RNMTO43148 476 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 DDX58O95786 925 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PDCP20941 246 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 NECTIN1Q15223 517 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 RASEFQ8IZ41 740 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 LINS1Q8NG48 757 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 MRC1P22897 1456 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 RFX7Q2KHR2 1363 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 TCHHQ07283 1943 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 KIAA2012Q0VF49 1180 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 TSGA10IPQ3SY00 556 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 SASS6Q6UVJ0 657 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 PDRG1Q9NUG6 133 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 ELP1O95163 1332 aa17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms