RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.27■■□□□ 1.48
SGO1-208ENST00000437051 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.26■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.26■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 POTEIP0CG38 1075 aa24.25■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 POTEJP0CG39 1038 aa24.25■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 COPS6Q7L5N1 327 aa24.25■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 ALDH1B1P30837 517 aa24.24■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 CCDC184Q52MB2 194 aa24.24■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 ZNF853P0CG23 659 aa24.23■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.23■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 SYNE4Q8N205 404 aa24.23■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.23■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 PARP10Q53GL7 1025 aa24.22■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.22■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 NLRP10Q86W26 655 aa24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 CFAP44Q96MT7 982 aa24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 MBIPQ9NS73 344 aa24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 COL4A1P02462 1669 aa24.21■■□□□ 1.47
SGO1-208ENST00000437051 SCN4AP35499 1836 aa24.2■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 APAF1O14727 1248 aa24.2■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
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SGO1-208ENST00000437051 PSMD1Q99460 953 aa24.2■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 LTBP1Q14766 1721 aa24.19■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.19■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 KLRG1Q96E93 195 aa24.19■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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SGO1-208ENST00000437051 HOXB7P09629 217 aa24.18■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 TCIRG1Q13488 830 aa24.18■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 PCNTO95613 3336 aa24.18■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 TAF1P21675 1872 aa24.17■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.17■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 ZNF428Q96B54 188 aa24.17■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 ABCC4O15439 1325 aa24.16■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
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SGO1-208ENST00000437051 JMYQ8N9B5 988 aa24.16■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.14■■□□□ 1.46
SGO1-208ENST00000437051 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 NLRP3Q96P20 1036 aa24.14■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.14■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.14■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.13■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.13■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.13■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.13■■□□□ 1.45
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SGO1-208ENST00000437051 PASKQ96RG2 1323 aa24.1■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.1■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
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SGO1-208ENST00000437051 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.08■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.08■■□□□ 1.45
SGO1-208ENST00000437051 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 LDHDQ86WU2 507 aa24.07■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 GPC2Q8N158 579 aa24.07■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 HYPKQ9NX55 129 aa24.07■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 HACL1Q9UJ83 578 aa24.07■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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SGO1-208ENST00000437051 TSPYL6Q8N831 410 aa24.06■■□□□ 1.44
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SGO1-208ENST00000437051 GRAPQ13588 217 aa24.05■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.05■■□□□ 1.44
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SGO1-208ENST00000437051 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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SGO1-208ENST00000437051 SP8Q8IXZ3 490 aa24.04■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 JDP2Q8WYK2 163 aa24.04■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 BBOX1O75936 387 aa24.03■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 PPIP5K2O43314 1243 aa24.02■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SGO1-208ENST00000437051 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SGO1-208ENST00000437051 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SGO1-208ENST00000437051 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
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