RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	C8orf37	Q96NL8	207 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	ABCC8	Q09428	1581 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	MICAL2	O94851	1124 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	DAB2	P98082	770 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	SPINT1	O43278	529 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	GDF9	O60383	454 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	IGHA2	P01877	340 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	SMPD1	P17405	629 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	IER5	Q5VY09	327 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PUM2-208	ENST00000432105	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	BMP2	P12643	396 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	EPB42	P16452	691 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PHKA2	P46019	1235 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SUSD3	Q96L08	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	GNA15	P30679	374 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	IDH3A	P50213	366 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	ARSD	P51689	593 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PRR20E	P86478	221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PRR20C	P86479	221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PRR20D	P86480	221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PRR20B	P86481	221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PRR20A	P86496	221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SYNJ1	O43426	1573 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	HPS1	Q92902	700 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SOGA1	O94964	1423 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105		A0A1B0GTH6	734 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	POU4F2	Q12837	409 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	ORC1	Q13415	861 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	RNF34	Q969K3	372 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	DRC1	Q96MC2	740 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	BCS1L	Q9Y276	419 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF76	P36508	570 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SCARF1	Q14162	830 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105		A6NHS1	94 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	RNF217	Q8TC41	542 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PUM2-208	ENST00000432105	OPLAH	O14841	1288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PUM2-208	ENST00000432105	GIPC1	O14908	333 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PUM2-208	ENST00000432105	PHACTR2	O75167	634 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PUM2-208	ENST00000432105	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PUM2-208	ENST00000432105	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PUM2-208	ENST00000432105	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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