RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GPTP24298 496 aa20.18■□□□□ 0.82
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYNE4Q8N205 404 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 CFAP44Q96MT7 982 aa20.14■□□□□ 0.81
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 IFT57Q9NWB7 429 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.06■□□□□ 0.8
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NECTIN2Q92692 538 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.05■□□□□ 0.8
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 APAF1O14727 1248 aa20.02■□□□□ 0.8
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HOXB-AS3-201ENST00000429755 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MPNDQ8N594 471 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPIP5K2O43314 1243 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CNTROBQ8N137 903 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GJA3Q9Y6H8 435 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CDHR2Q9BYE9 1310 aa19.99■□□□□ 0.79
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