RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.22■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 PSMD1Q99460 953 aa27.21■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
UBXN4-204ENST00000426921 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.2■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 COPS6Q7L5N1 327 aa27.2■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.2■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP44Q96MT7 982 aa27.2■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.2■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 HTRA3P83110 453 aa27.19■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.19■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.18■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.18■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 NECTIN2Q92692 538 aa27.18■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 KLRG1Q96E93 195 aa27.18■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 SCN4AP35499 1836 aa27.18■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 SYNE4Q8N205 404 aa27.17■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 NLRP10Q86W26 655 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 NLRP3Q96P20 1036 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.16■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 FZD9O00144 591 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF853P0CG23 659 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 TCIRG1Q13488 830 aa27.14■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 JMYQ8N9B5 988 aa27.14■■□□□ 1.94
UBXN4-204ENST00000426921 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 MBIPQ9NS73 344 aa27.13■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 COL4A5P29400 1685 aa27.13■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 LAMB2P55268 1798 aa27.12■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 CHADLQ6NUI6 762 aa27.12■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 APAF1O14727 1248 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 POTEIP0CG38 1075 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 POTEJP0CG39 1038 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 IFT57Q9NWB7 429 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC4O15439 1325 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 SLC51AQ86UW1 340 aa27.09■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.09■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 LDHDQ86WU2 507 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 GPC2Q8N158 579 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 JDP2Q8WYK2 163 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 HYPKQ9NX55 129 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN4-204ENST00000426921 GNAI1P63096 354 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 HACL1Q9UJ83 578 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 PCNTO95613 3336 aa27.05■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 BBOX1O75936 387 aa27.04■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 VPS33BQ9H267 617 aa27.04■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 EPHX2P34913 555 aa27.03■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 IFFO2Q5TF58 517 aa27.03■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.03■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 PASKQ96RG2 1323 aa27.03■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 CREBZFQ9NS37 354 aa27.02■■□□□ 1.92
UBXN4-204ENST00000426921 GRAPQ13588 217 aa27.01■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 SP8Q8IXZ3 490 aa27.01■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.01■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 LTBP1Q14766 1721 aa27■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 PPIP5K2O43314 1243 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC184Q52MB2 194 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 TMC4Q7Z404 712 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 NIM1KQ8IY84 436 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 SCNN1DP51172 638 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 AOC3Q16853 763 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC27Q2M243 656 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 FAM89AQ96GI7 184 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms