RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417464.6

UPP1-205, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 782 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-205ENST00000417464 PARP10Q53GL7 1025 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.98■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 CRY2Q49AN0 593 aa24.97■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 WDR63Q8IWG1 891 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.95■■□□□ 1.59
UPP1-205ENST00000417464 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.95■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 GOLGA2Q08379 1002 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 G2E3Q7L622 706 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 LMNB1P20700 586 aa24.93■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 SBF1O95248 1867 aa24.93■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 MYD88Q99836 296 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 FAM89AQ96GI7 184 aa24.91■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 ZNF521Q96K83 1311 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 CCDC93Q567U6 631 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 NLRP3Q96P20 1036 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 STK31Q9BXU1 1019 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-205ENST00000417464 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.89■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 VAMP4O75379 141 aa24.88■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 SLC4A2P04920 1241 aa24.88■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 C1QTNF8P60827 252 aa24.88■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 KIF3CO14782 793 aa24.87■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 ALDH1B1P30837 517 aa24.87■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 LAMB2P55268 1798 aa24.87■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 SNED1Q8TER0 1413 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 ABCC4O15439 1325 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 COL4A1P02462 1669 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 CCER2I3L3R5 266 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 SOGA3Q5TF21 947 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.84■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 MIER1Q8N108 512 aa24.84■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.84■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
UPP1-205ENST00000417464 IGKV5-2P06315 115 aa24.82■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 FLIIQ13045 1269 aa24.82■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 KSR2Q6VAB6 950 aa24.82■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 RRAGCQ9HB90 399 aa24.81■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 COL4A5P29400 1685 aa24.79■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.79■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 TAF1P21675 1872 aa24.79■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 GLTPD2A6NH11 291 aa24.77■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UPP1-205ENST00000417464 F6X3S4 739 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 GRAPQ13588 217 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.75■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms