RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP31Q70CQ4 1352 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 A6NHS1 94 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNFRSF21O75509 655 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 MEIOBQ8N635 442 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 C12orf49Q9H741 205 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.65□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP2B1P20020 1258 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 INPP5BP32019 993 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 IDH3AP50213 366 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARSDP51689 593 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNNI2P48788 182 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXC1Q12948 553 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR44Q5JSH3 913 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 POTEGQ6S5H5 508 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 DPH6Q7L8W6 267 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 AIDAQ96BJ3 306 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 J3QL48 77 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPINT1O43278 529 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARID5AQ03989 594 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP48Q86UV5 1035 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 POTECB2RU33 542 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBL2Q08999 1139 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF394Q53GI3 561 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP4X1Q8N118 509 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ELP3Q9H9T3 547 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 GGT7Q9UJ14 662 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHACTR2O75167 634 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMPD1P17405 629 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHKA2P46019 1235 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 PI16Q6UXB8 463 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS37DQ86XT2 251 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLRG1Q96E93 195 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZIC5Q96T25 663 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 LNPKQ9C0E8 428 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 GDF9O60383 454 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP4AP20648 1035 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 IRS1P35568 1242 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SOGA3Q5TF21 947 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 PMEPA1Q969W9 287 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 EGFRP00533 1210 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP17L7P0C7H9 530 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPB42P16452 691 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 GJA8P48165 433 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 POU4F2Q12837 409 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 BCO2Q9BYV7 579 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.58□□□□□ -1.36
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