RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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C10orf55-201ENST00000409178 LARGE1O95461 756 aa26.03■■□□□ 1.76
C10orf55-201ENST00000409178 BRINP3Q76B58 766 aa26.03■■□□□ 1.76
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C10orf55-201ENST00000409178 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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C10orf55-201ENST00000409178 MAP4K1Q92918 833 aa25.96■■□□□ 1.75
C10orf55-201ENST00000409178 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.96■■□□□ 1.75
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C10orf55-201ENST00000409178 TNNI3KQ59H18 835 aa25.95■■□□□ 1.75
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C10orf55-201ENST00000409178 MBD3O95983 291 aa25.94■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.94■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.94■■□□□ 1.74
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C10orf55-201ENST00000409178 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.94■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.94■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 SLC27A2O14975 620 aa25.93■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 SYT1P21579 422 aa25.93■■□□□ 1.74
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C10orf55-201ENST00000409178 USP48Q86UV5 1035 aa25.93■■□□□ 1.74
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C10orf55-201ENST00000409178 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.91■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.91■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
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C10orf55-201ENST00000409178 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 COL15A1P39059 1388 aa25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 ATP5JP18859 108 aa25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 NECAB1Q8N987 351 aa25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.9■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 GJB2P29033 226 aa25.89■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.89■■□□□ 1.74
C10orf55-201ENST00000409178 FOXO4P98177 505 aa25.89■■□□□ 1.73
C10orf55-201ENST00000409178 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
C10orf55-201ENST00000409178 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.89■■□□□ 1.73
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