RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 TSKSQ9UJT2 592 aa25.91■■□□□ 1.74
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HOXD12-201ENST00000404162 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 RGL2O15211 777 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC12Q96J65 1359 aa25.88■■□□□ 1.73
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HOXD12-201ENST00000404162 SLC51AQ86UW1 340 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 AOC2O75106 756 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 CRY2Q49AN0 593 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 MCM10Q7L590 875 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 MAP2K2P36507 400 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD12-201ENST00000404162 DCTN1Q14203 1278 aa25.83■■□□□ 1.73
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HOXD12-201ENST00000404162 NYXQ9GZU5 481 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXD12-201ENST00000404162 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
HOXD12-201ENST00000404162 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
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HOXD12-201ENST00000404162 CFAP44Q96MT7 982 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD12-201ENST00000404162 NUP98P52948 1817 aa25.79■■□□□ 1.72
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HOXD12-201ENST00000404162 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.78■■□□□ 1.72
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HOXD12-201ENST00000404162 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD12-201ENST00000404162 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD12-201ENST00000404162 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD12-201ENST00000404162 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.76■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.76■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 PPIP5K2O43314 1243 aa25.75■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 SUSD4Q5VX71 490 aa25.75■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 CFAP53Q96M91 514 aa25.72■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
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HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
HOXD12-201ENST00000404162 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 NTSR2O95665 410 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 NUDCQ9Y266 331 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 MYL6BP14649 208 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 ZIC5Q96T25 663 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 VPS33BQ9H267 617 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP3Q96P20 1036 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 RAD17O75943 681 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC4O15439 1325 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 SHTN1A0MZ66 631 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 DLK2Q6UY11 383 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 NOGQ13253 232 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.61■■□□□ 1.69
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