RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa19.98■□□□□ 0.79
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SH3BP4-202ENST00000392011 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 MFSD6Q6ZSS7 791 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 CPLX3Q8WVH0 158 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa19.97■□□□□ 0.79
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SH3BP4-202ENST00000392011 SLC26A6Q9BXS9 759 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC96Q2M329 555 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP2B3Q16720 1220 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 PZPP20742 1482 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 MCM5P33992 734 aa19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPY2A6NKD2 308 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.95■□□□□ 0.78
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SH3BP4-202ENST00000392011 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 GCP02774 474 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF18AQ8NI77 898 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR62O43379 1518 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 NPHP3Q7Z494 1330 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNA6P17658 529 aa19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4-202ENST00000392011 CENPHQ9H3R5 247 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 VAT1LQ9HCJ6 419 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 G2E3Q7L622 706 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX21Q969T3 373 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM193AP78312 1265 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA0556O60303 1618 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC66A2RUB6 948 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ZSCAN12O43309 604 aa19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP4-202ENST00000392011 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP4-202ENST00000392011 TSPYL1Q9H0U9 437 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP4-202ENST00000392011 STX1AQ16623 288 aa19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP4-202ENST00000392011 TNNT1P13805 278 aa19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA6L10A6NI86 522 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 UBA5Q9GZZ9 404 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 TMC6Q7Z403 805 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZUG5 572 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 STX8Q9UNK0 236 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC102BQ68D86 513 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB34Q9BZG1 259 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 LDHCP07864 332 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.783e-9■■■■■ 40.7
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SH3BP4-202ENST00000392011 HOXC9P31274 260 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 PDE4BQ07343 736 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP15Q5T1M5 1219 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 LRSAM1Q6UWE0 723 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB43O43298 467 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 SPA17Q15506 151 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC102AQ96A19 550 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 NBPF4Q96M43 638 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 MSH6P52701 1360 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP7A1P22680 504 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC1P33527 1531 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF5BP33176 963 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF4BQ92750 862 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K5Q99683 1374 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
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