RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 EYA1Q99502 592 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 ATG3Q9NT62 314 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RNF181Q9P0P0 153 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 WDR90Q96KV7 1748 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.58□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 C4AP0C0L4 1744 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGAP33O14559 1287 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 TOMM70O94826 608 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PHKG2P15735 406 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RFC4P35249 363 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KDRP35968 1356 aa6.57□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 MAP3K7O43318 606 aa6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 GYS1P13807 737 aa6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RRAGCQ9HB90 399 aa6.56□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 CABP4P57796 275 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 DDR1Q08345 913 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PTGDRQ13258 359 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 TNS4Q8IZW8 715 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KLRG1Q96E93 195 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.55□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 FECHP22830 423 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 TGFB2P61812 414 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RGS22Q8NE09 1264 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KCNK17Q96T54 332 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PIM2Q9P1W9 311 aa6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 NCAPD2Q15021 1401 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 TK2O00142 265 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RPS6KA4O75676 772 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KCNA3P22001 575 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 WWC1Q8IX03 1113 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 RETREG2Q8NC44 543 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 BANK1Q8NDB2 785 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 POLKQ9UBT6 870 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.53□□□□□ -1.36
TMLHE-202ENST00000369439 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 CDCA8Q53HL2 280 aa6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 POM121Q96HA1 1249 aa6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 DCAF5Q96JK2 942 aa6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 TJP1Q07157 1748 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 PSEN2P49810 448 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 MTHFSP49914 203 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 SLC39A6Q13433 755 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.51□□□□□ -1.37
TMLHE-202ENST00000369439 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms