RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 F6X3S4 739 aa20.49■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 TGFB2P61812 414 aa20.49■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.49■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 NYXQ9GZU5 481 aa20.49■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.48■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.48■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 SYNE4Q8N205 404 aa20.48■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.48■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 KCNA3P22001 575 aa20.47■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.47■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.47■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.46■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.46■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 IGKV5-2P06315 115 aa20.46■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PDSS2-201ENST00000369031 PDE6BP35913 854 aa20.45■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.45■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.44■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 FAM89AQ96GI7 184 aa20.44■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.44■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.43■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 H0YIN7 160 aa20.43■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 GPR162Q16538 588 aa20.43■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.43■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 SLX4Q8IY92 1834 aa20.42■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.42■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 BCS1LQ9Y276 419 aa20.42■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 SRGNP10124 158 aa20.41■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.41■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 PIM2Q9P1W9 311 aa20.41■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 PTPRCP08575 1304 aa20.41■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 MYH3P11055 1940 aa20.41■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 BCAR3O75815 825 aa20.4■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 TAF1P21675 1872 aa20.4■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 BEND3Q5T5X7 828 aa20.4■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PDSS2-201ENST00000369031 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 LINS1Q8NG48 757 aa20.39■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 COL4A1P02462 1669 aa20.38■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 KIF16BQ96L93 1317 aa20.38■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 CRY2Q49AN0 593 aa20.38■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.38■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 MASTLQ96GX5 879 aa20.38■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 NPR1P16066 1061 aa20.37■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 GCKRQ14397 625 aa20.37■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 STYK1Q6J9G0 422 aa20.37■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.37■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 TTLL6Q8N841 843 aa20.37■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.37■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.36■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 NLRP3Q96P20 1036 aa20.36■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 TNNQ9UQP3 1299 aa20.36■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 SLC51AQ86UW1 340 aa20.35■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.35■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 SPEF2Q9C093 1822 aa20.34■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.34■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 CHD4Q14839 1912 aa20.34■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 UTRNP46939 3433 aa20.34■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 H7C1W4 665 aa20.33■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 CASP7P55210 303 aa20.33■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 CNKSR1Q969H4 720 aa20.33■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC4O15439 1325 aa20.32■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 ALDH1L1O75891 902 aa20.32■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.32■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 C21orf2O43822 256 aa20.31■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 GRIN3BO60391 1043 aa20.31■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 OLFM4Q6UX06 510 aa20.31■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 GRM8O00222 908 aa20.3■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 PDE8AO60658 829 aa20.3■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 TRIM27P14373 513 aa20.3■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.3■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 CTSWP56202 376 aa20.29■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PDSS2-201ENST00000369031 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms