RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNQ4P56696 695 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF43Q68DV7 783 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 C7orf69Q9H7B7 122 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRD7Q9NPI1 651 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP3Q9Y6I4 520 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM42Q8IWZ5 723 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 TP53INP2Q8IXH6 220 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNH4Q9UQ05 1017 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMX2A2RU54 273 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 A6NJY4 79 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 EML1O00423 815 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTFR1Q15390 333 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 KSR1Q8IVT5 923 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARMC10Q8N2F6 343 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHKBP1Q8TBC3 707 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXL18Q96ME1 805 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP63Q96MT8 703 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRRS1LQ9P0K9 344 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC39Q9UFE4 941 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERTAD1Q9UHV2 236 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 DOLKQ9UPQ8 538 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPB1P15086 417 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM35AQ86V20 835 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIRT1Q96EB6 747 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 AK7Q96M32 723 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC4A9Q96Q91 983 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 LPIN3Q9BQK8 851 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 EFCC1Q9HA90 598 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP126Q9P2H0 1117 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAPLNO95428 1278 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLAURQ03405 335 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE4DQ08499 809 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL19A1Q14993 1142 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 UVSSAQ2YD98 709 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSGA10IPQ3SY00 556 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 OXLD1Q5BKU9 147 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 VSIG10LQ86VR7 867 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHPN1Q8TCX5 695 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 C7orf43Q8WVR3 580 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 L3MBTL2Q969R5 705 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSRNP1Q96S65 589 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC38A3Q99624 504 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFI1A8K8P3 1242 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR64B1ANS9 1081 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRNPP04156 253 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TYRO3Q06418 890 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEAD4Q15561 434 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCSK7Q16549 785 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSMPQ1L6U9 139 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3D19Q5HYK7 790 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PERM1Q5SV97 790 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFXL1Q6ZNB6 911 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCAF11Q8TEB1 546 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC9Q92623 222 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNMA5Q96PV4 448 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP41Q9BYV8 373 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIM2Q9P1W9 311 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM229AB2RXF0 380 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOS2P35228 1153 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM132AQ24JP5 1023 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLEC10AQ8IUN9 316 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGBL5Q8NDL9 886 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSH2DQ96JZ2 352 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TOX2Q96NM4 488 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM83CQ9BQN1 747 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 BIN1O00499 593 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFKB1P19838 968 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRNP28799 593 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 RFC5P40937 340 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTLL10Q6ZVT0 673 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP4K3Q8IVH8 894 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYRFLQ96LU7 910 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF232Q9UNY5 417 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms