RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 USP32Q8NFA0 1604 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KCNQ3O43525 872 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 USP5P45974 858 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RCAN3Q9UKA8 241 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH6O60337 910 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A1P13866 664 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 NPR1P16066 1061 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 NFIXQ14938 502 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SLF2Q8IX21 1173 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 NARFQ9UHQ1 456 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 LDHCP07864 332 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RGS3P49796 1198 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RILPL2Q969X0 211 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SRGAP3O43295 1099 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CSADQ9Y600 493 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 LMNB1P20700 586 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SYNE4Q8N205 404 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2IP78347 998 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PICALMQ13492 652 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 WDR63Q8IWG1 891 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 STRCP1A6NGW2 1772 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 FLIIQ13045 1269 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KRT24Q2M2I5 525 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 HACL1Q9UJ83 578 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ECE1P42892 770 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SLFN5Q08AF3 891 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 IL17REQ8NFR9 667 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CABP5Q9NP86 173 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP12Q02952 1782 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 BBOX1O75936 387 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 USP19O94966 1318 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PICK1Q9NRD5 415 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 COG6Q9Y2V7 657 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 GNAI2P04899 355 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 HUNKP57058 714 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TGFB2P61812 414 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SNRKQ9NRH2 765 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 RTL1A6NKG5 1358 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KIF16BQ96L93 1317 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 IFT57Q9NWB7 429 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 KIF1AQ12756 1690 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 BAG3O95817 575 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TRDNQ13061 729 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ITPK1Q13572 414 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF827Q17R98 1081 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-201ENST00000348564 PDE8AO60658 829 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DOAP06340 250 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5.4□□□□□ -1.55
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