RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC66A2RUB6 948 aa18.18■□□□□ 0.5
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PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP100Q494V2 611 aa18.18■□□□□ 0.5
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PTPRU-201ENST00000345512 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.12■□□□□ 0.49
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PTPRU-201ENST00000345512 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRU-201ENST00000345512 ATP7BP35670 1465 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-201ENST00000345512 XBP1P17861 261 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-201ENST00000345512 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-201ENST00000345512 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-201ENST00000345512 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-201ENST00000345512 MTMR6Q9Y217 621 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-201ENST00000345512 METP08581 1390 aa18.1■□□□□ 0.49
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