RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF4Q96M43 638 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 USP25Q9UHP3 1055 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DOAP06340 250 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 TMC6Q7Z403 805 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 NEK1Q96PY6 1258 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 CTNNA2P26232 953 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 LDHCP07864 332 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 PIK3R4Q99570 1358 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 NCOA7Q8NI08 942 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 KIF20AO95235 890 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE5O15320 804 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 PRC1O43663 620 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 STX6O43752 255 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 AMPD3Q01432 767 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 KIF18AQ8NI77 898 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 GBP3Q9H0R5 595 aa25.78■■□□□ 1.72
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PTPRM-201ENST00000332175 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.77■■□□□ 1.72
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PTPRM-201ENST00000332175 UBE4AQ14139 1066 aa25.76■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 STX8Q9UNK0 236 aa25.76■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1AP38606 617 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.76■■□□□ 1.71
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PTPRM-201ENST00000332175 TSPY3P0CV98 308 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 TSPY8P0CW00 308 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 STX1AQ16623 288 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 PICALMQ13492 652 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 MYO1BO43795 1136 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 CETN1Q12798 172 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A6Q13433 755 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 TTC22Q5TAA0 569 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 UBA7P41226 1012 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 NECAB1Q8N987 351 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.75■■□□□ 1.71
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PTPRM-201ENST00000332175 DRC1Q96MC2 740 aa25.75■■□□□ 1.71
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PTPRM-201ENST00000332175 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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PTPRM-201ENST00000332175 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 GSTO1P78417 241 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 SHTN1A0MZ66 631 aa25.72■■□□□ 1.71
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PTPRM-201ENST00000332175 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 IGHDP01880 384 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 CA8P35219 290 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 NCOA1Q15788 1441 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 ALS2CR12Q96Q35 445 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.715e-7■■■■□ 21.9
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PTPRM-201ENST00000332175 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 SETDB2Q96T68 719 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRM-201ENST00000332175 MCM5P33992 734 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC1Q9NV70 894 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 AFMP43652 599 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 CBX1P83916 185 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 BRF1Q92994 677 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 TTC16Q8NEE8 873 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 ADCY5O95622 1261 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 MYZAPP0CAP1 466 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 COPS6Q7L5N1 327 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM47Q96LD4 638 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-201ENST00000332175 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
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