RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 CAMTA2O94983 1202 aa21.84■■□□□ 1.09
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SFTPC-201ENST00000318561 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.84■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.84■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.84■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 TSPYL6Q8N831 410 aa21.83■■□□□ 1.09
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SFTPC-201ENST00000318561 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.83■■□□□ 1.09
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SFTPC-201ENST00000318561 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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SFTPC-201ENST00000318561 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.82■■□□□ 1.08
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SFTPC-201ENST00000318561 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.81■■□□□ 1.08
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SFTPC-201ENST00000318561 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.79■■□□□ 1.08
SFTPC-201ENST00000318561 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.79■■□□□ 1.08
SFTPC-201ENST00000318561 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.79■■□□□ 1.08
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SFTPC-201ENST00000318561 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.78■■□□□ 1.08
SFTPC-201ENST00000318561 HYPKQ9NX55 129 aa21.78■■□□□ 1.08
SFTPC-201ENST00000318561 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.77■■□□□ 1.08
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SFTPC-201ENST00000318561 CAPNS2Q96L46 248 aa21.77■■□□□ 1.08
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SFTPC-201ENST00000318561 HACL1Q9UJ83 578 aa21.76■■□□□ 1.07
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SFTPC-201ENST00000318561 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.73■■□□□ 1.07
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SFTPC-201ENST00000318561 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.71■■□□□ 1.07
SFTPC-201ENST00000318561 SCN4AP35499 1836 aa21.71■■□□□ 1.07
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SFTPC-201ENST00000318561 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.71■■□□□ 1.07
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SFTPC-201ENST00000318561 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.69■■□□□ 1.06
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SFTPC-201ENST00000318561 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.68■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 NPHP1O15259 732 aa21.67■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 SOGA3Q5TF21 947 aa21.67■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 LTBP1Q14766 1721 aa21.66■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 GPTP24298 496 aa21.66■■□□□ 1.06
SFTPC-201ENST00000318561 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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