RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 PTGS1P23219 599 aa29.33■■■□□ 2.29
PKDCC-201ENST00000294964 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.33■■■□□ 2.29
PKDCC-201ENST00000294964 SMTNL1A8MU46 457 aa29.32■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 TERF2Q15554 542 aa29.32■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC37A3O60309 1634 aa29.32■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.32■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 ABCA3Q99758 1704 aa29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 KIF18AQ8NI77 898 aa29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 MCCP23508 829 aa29.3■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 CHMLP26374 656 aa29.3■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC66A2RUB6 948 aa29.29■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.29■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 SRGAP3O43295 1099 aa29.28■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.28■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 ANAPC15P60006 121 aa29.28■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 BTBD11A6QL63 1104 aa29.27■■■□□ 2.28
PKDCC-201ENST00000294964 FIBPO43427 364 aa29.26■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 TEFQ10587 303 aa29.26■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 PLCD3Q8N3E9 789 aa29.26■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 TNNT1P13805 278 aa29.25■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 LRMPQ12912 555 aa29.25■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.25■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 KRT222Q8N1A0 295 aa29.24■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 SSH3Q8TE77 659 aa29.24■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 TIGD1Q96MW7 591 aa29.24■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 PROSER3Q2NL68 480 aa29.24■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.24■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC112Q8NEF3 446 aa29.23■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.22■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.22■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 BEND3Q5T5X7 828 aa29.22■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 RHPN1Q8TCX5 695 aa29.22■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 RGPD5Q99666 1765 aa29.21■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 STAP2Q9UGK3 403 aa29.2■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.2■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa29.2■■■□□ 2.27
PKDCC-201ENST00000294964 DTNBO60941 627 aa29.2■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 ERICH4A6NGS2 130 aa29.19■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 COL18A1P39060 1754 aa29.19■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.19■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC192P0DO97 292 aa29.18■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 KLHL34Q8N239 644 aa29.18■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 STX6O43752 255 aa29.18■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.18■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 IL17RAQ96F46 866 aa29.18■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.18■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 F13A1P00488 732 aa29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 SYT1P21579 422 aa29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 SLC20A2Q08357 652 aa29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 CACNA1FO60840 1977 aa29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 POLA2Q14181 598 aa29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 PI4K2BQ8TCG2 481 aa29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 FAM200AQ8TCP9 573 aa29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 ADCY9O60503 1353 aa29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.16■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.15■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 LUZP1Q86V48 1076 aa29.15■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 FAM53CQ9NYF3 392 aa29.15■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 CAPN2P17655 700 aa29.14■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.14■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 CPDO75976 1380 aa29.14■■■□□ 2.26
PKDCC-201ENST00000294964 DRC7Q8IY82 874 aa29.14■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa29.13■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 TULP2O00295 520 aa29.13■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF592Q92610 1267 aa29.12■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 ST7Q9NRC1 585 aa29.12■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 SPG7Q9UQ90 795 aa29.12■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 CHRNA2Q15822 529 aa29.12■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa29.12■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
PKDCC-201ENST00000294964 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms