RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 F13A1P00488 732 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ANAPC15P60006 121 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CTAGE9A4FU28 777 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SYKP43405 635 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MYD88Q99836 296 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TOPBP1Q92547 1522 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF76P36508 570 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 KANK3Q6NY19 840 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HSF2BPO75031 334 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TSG101Q99816 390 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HAND2P61296 217 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PHACTR2O75167 634 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC96Q2M329 555 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NLRP5P59047 1200 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TYRO3Q06418 890 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NME9Q86XW9 330 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RAB34Q9BZG1 259 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 A0A087WZG4 1122 aa7.27□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NF2P35240 595 aa7.27□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.27□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PAF1Q8N7H5 531 aa7.27□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 VPS18Q9P253 973 aa7.27□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MYH6P13533 1939 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 OSCARQ8IYS5 282 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 GTF3C6Q969F1 213 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 FEZ1Q99689 392 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 N4BP3O15049 544 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 MYO1BO43795 1136 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 RLBP1P12271 317 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 MAP3K12Q12852 859 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 CTAGE8P0CG41 777 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.251e-8■■■■□ 21.9
SBNO1-201ENST00000267176 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 BRF1Q92994 677 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 OGFRQ9NZT2 677 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 USP16Q9Y5T5 823 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 RAPGEF3O95398 923 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 FBLN1P23142 703 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 AK2P54819 239 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 MYO10Q9HD67 2058 aa7.27□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 TNNQ9UQP3 1299 aa7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 IL16Q14005 1332 aa7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 CETN2P41208 172 aa7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 AFMP43652 599 aa7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 HSPA4P34932 840 aa7.26□□□□□ -1.25
SBNO1-201ENST00000267176 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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