RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 STK3Q13188 491 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 WASHC4Q2M389 1173 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 GPT2Q8TD30 523 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 GCP02774 474 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CCP110O43303 1012 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NEMFO60524 1076 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 EVA1CP58658 441 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NBPF4Q96M43 638 aa10.42□□□□□ -0.74
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HERC3-201ENST00000264345 USP25Q9UHP3 1055 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 PALD1Q9ULE6 856 aa10.42□□□□□ -0.74
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HERC3-201ENST00000264345 JMYQ8N9B5 988 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 LGR6Q9HBX8 967 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ANXA1P04083 346 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ATL3Q6DD88 541 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 SDF4Q9BRK5 362 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 STK38Q15208 465 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 RPS6KB1P23443 525 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WZG4 1122 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 KDM4AO75164 1064 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 MTX1Q13505 466 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 DCAF5Q96JK2 942 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 ANO10Q9NW15 660 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 C3P01024 1663 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 SLC27A2O14975 620 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 PKP1Q13835 747 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
HERC3-201ENST00000264345 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SPC24Q8NBT2 197 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 COPS6Q7L5N1 327 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 STX1AQ16623 288 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 FERMT3Q86UX7 667 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TICAM2Q86XR7 235 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 OLFM4Q6UX06 510 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 AKAP12Q02952 1782 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JS52 829 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SMTNL1A8MU46 457 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ME1P48163 572 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ERICH2A1L162 156 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 APPP05067 770 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ZNF790Q6PG37 636 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SUCLG2Q96I99 432 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 GIMAP6Q6P9H5 292 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 NECAB1Q8N987 351 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CBFA2T2O43439 604 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 CAMK4Q16566 473 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-201ENST00000264345 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.37□□□□□ -0.75
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