RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC192P0DO97 292 aa15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PTGS1P23219 599 aa15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GRM8O00222 908 aa15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TTC6Q86TZ1 520 aa15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CHRNA2Q15822 529 aa15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 EVI5LQ96CN4 794 aa15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 LRMPQ12912 555 aa15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RNF20Q5VTR2 975 aa15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 KSR2Q6VAB6 950 aa15.92■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SNRKQ9NRH2 765 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PYCARDQ9ULZ3 195 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SLC27A2O14975 620 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SASH1O94885 1247 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 HS1BP3Q53T59 392 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 BRF1Q92994 677 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 DLC1Q96QB1 1528 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 POLA2Q14181 598 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 MAP3K11Q16584 847 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TTC14Q96N46 770 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.91■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.9■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.9■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.9■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 AP5Z1O43299 807 aa15.9■□□□□ 0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GCP02774 474 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PSMA5P28066 241 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TFCP2Q12800 502 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 IP6K1Q92551 441 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SIRT1Q96EB6 747 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ISM2Q6H9L7 571 aa15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 HAND2P61296 217 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TIMM10P62072 90 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GORABQ5T7V8 394 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 VPS53Q5VIR6 699 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PTPRUQ92729 1446 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087WZG4 1122 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GOLIM4O00461 696 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TYRO3Q06418 890 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZUG5 572 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 USP16Q9Y5T5 823 aa15.88■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 BECN2A8MW95 431 aa15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TBX22Q9Y458 520 aa15.87■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NR1I2O75469 434 aa15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TCHHQ07283 1943 aa15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 KIF3AQ9Y496 699 aa15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 LINS1Q8NG48 757 aa15.86■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF165P49910 485 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 WASHC4Q2M389 1173 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ADCY9O60503 1353 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 MCM5P33992 734 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ME1P48163 572 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 APOBRQ0VD83 1088 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.85■□□□□ 0.13
TMOD1-201ENST00000259365 BIN1O00499 593 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms