RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.54□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 BCS1LQ9Y276 419 aa8.54□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.54□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.54□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 PCSK2P16519 638 aa8.53□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 TRIM32Q13049 653 aa8.53□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.53□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MDM2-201ENST00000258148 POTECB2RU33 542 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 C8orf34Q49A92 452 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 NBPF15Q8N660 670 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 TRIM52Q96A61 297 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 IFT57Q9NWB7 429 aa8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ST18O60284 1047 aa8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 TNFRSF21O75509 655 aa8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ANAPC15P60006 121 aa8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 CNKSR1Q969H4 720 aa8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 STAC3Q96MF2 364 aa8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 IL21Q9HBE4 155 aa8.51□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 KLF4O43474 513 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 CLSTN1O94985 981 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.5□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 RASA3Q14644 834 aa8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ARID5BQ14865 1188 aa8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SPON2Q9BUD6 331 aa8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.49□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ETFBP38117 255 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 XKR5Q6UX68 686 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SNTG2Q9NY99 539 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 CCDC181Q5TID7 509 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 MPNDQ8N594 471 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 OTUD5Q96G74 571 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 NPHS2Q9NP85 383 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 CABP1Q9NZU7 370 aa8.48□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 MICAL2O94851 1124 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 MAP3K10Q02779 954 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 CLN3Q13286 438 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 RAB33AQ14088 237 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 BCO2Q9BYV7 579 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.47□□□□□ -1.05
MDM2-201ENST00000258148 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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MDM2-201ENST00000258148 NR3C2P08235 984 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TXLNAP40222 546 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 SOX9P48436 509 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 SPC25Q9HBM1 224 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 GINM1Q9NU53 330 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.46□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 ADH1CP00326 375 aa8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 CENPCQ03188 943 aa8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TTC16Q8NEE8 873 aa8.45□□□□□ -1.06
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