RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.36■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 TNS2Q63HR2 1409 aa24.36■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 MCM2P49736 904 aa24.36■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 DDB1Q16531 1140 aa24.36■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.36■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 NEK4P51957 841 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 POLA2Q14181 598 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 TMX3Q96JJ7 454 aa24.35■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 KAZALD1Q96I82 304 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 SUCLG2Q96I99 432 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 NRAPQ86VF7 1730 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 A0A0G2JS52 829 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 PDE1AP54750 535 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 NGLY1Q96IV0 654 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 PAPPAQ13219 1627 aa24.34■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 SLIT2O94813 1529 aa24.33■■□□□ 1.49
VGF-201ENST00000249330 GCKRQ14397 625 aa24.33■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.32■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.32■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 MCCP23508 829 aa24.32■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.32■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 BCL9O00512 1426 aa24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 MAP7D2Q96T17 732 aa24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 ITGB4P16144 1822 aa24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 BRD1O95696 1058 aa24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 UTYO14607 1347 aa24.3■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.3■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.3■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 JCADQ9P266 1359 aa24.29■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.29■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 UQCRHP07919 91 aa24.29■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 CERKQ8TCT0 537 aa24.29■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.29■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 CUL4AQ13619 759 aa24.28■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 RNF214Q8ND24 703 aa24.28■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 TSPY26PQ9H489 355 aa24.28■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 MTX1Q13505 466 aa24.27■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.27■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.27■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.27■■□□□ 1.48
VGF-201ENST00000249330 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 ANAPC15P60006 121 aa24.26■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.26■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.26■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 BARGINQ6ZT62 677 aa24.25■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.25■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 A0A087WZG4 1122 aa24.25■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.24■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.24■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.24■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 RAB11FIP3O75154 756 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 PHF14O94880 888 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 STARD3NLO95772 234 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 MX1P20591 662 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.23■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 DYNC1I1O14576 645 aa24.22■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 PALD1Q9ULE6 856 aa24.22■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 KCNQ2O43526 872 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.21■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
VGF-201ENST00000249330 CHMLP26374 656 aa24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.3 ms