RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfml1Q8BSH2 233 aa14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tango6Q8C3S2 1079 aa14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dot1lQ6XZL8 1540 aa14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ift74Q8BKE9 600 aa14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itga6Q61739 1091 aa14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eya2O08575 532 aa14.96□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc4a4O88343 1079 aa14.96□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msl1Q6PDM1 616 aa14.96□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Naa16Q9DBB4 864 aa14.96□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa14.96□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mdm2P23804 489 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb45Q52KG4 520 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim11Q99PQ2 467 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atg3Q9CPX6 314 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Terf2O35144 541 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LyarQ08288 388 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stim1P70302 685 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam170aQ66LM6 333 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc66Q6NS45 935 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RgmbQ7TQ33 436 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zkscan8Q8BSL0 588 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CpvlQ9D3S9 478 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif21bQ9QXL1 1668 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk36Q69ZM6 1316 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stat1P42225 749 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf704Q9ERQ3 566 aa14.95□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fndc1E9Q043 1732 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Erbb3Q61526 1339 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam1aQ60813 791 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taok3Q8BYC6 898 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnot6lQ8VEG6 555 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx6Q9JKK1 255 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RestQ8VIG1 1082 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc1a4O35874 532 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pla2g4fQ50L41 855 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps54Q5SPW0 977 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb43Q9DAI4 467 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KdrP35918 1367 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa14.94□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dennd3A2RT67 1274 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Metap2O08663 478 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NppbP40753 121 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Morc2aQ69ZX6 1030 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdca7Q9D0M2 382 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tns3Q5SSZ5 1440 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A0U1RNP2 1173 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syce3B5KM66 88 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q4VA45 678 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clcn1Q64347 994 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21985Q6P6P5 1106 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abtb2Q7TQI7 1024 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc12Q8BW49 704 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dbndd1Q9CZ00 160 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rlbp1Q9Z275 317 aa14.93□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sult6b1P0CC03 303 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ercc3P49135 783 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CltaO08585 235 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dcaf5Q80T85 946 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc172Q810N9 267 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gcom1E9PZ54 550 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl3d2F6R3P9 224 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MyzapQ3UIJ9 466 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Liat1Q810M6 228 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smim5Q8BT42 78 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf428Q8C1M2 176 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nek11Q8C0Q4 628 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 WtapQ9ER69 396 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa14.92□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rad50P70388 1312 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncf1Q09014 390 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep89Q9CZX2 791 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plagl1Q9JLQ4 704 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ano8Q6PB70 1060 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myom2Q14BI5 1463 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stox1B2RQL2 990 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Samd1D3YXK1 519 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DymQ8CHY3 669 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TnksQ6PFX9 1320 aa14.91□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rims1Q99NE5 1463 aa14.9□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syde2E9PUP1 1314 aa14.9□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F2rP30558 430 aa14.9□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp5P56399 858 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10093D3YYI8 482 aa14.9□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chl1P70232 1209 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.5 ms