RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 RereQ80TZ9 1558 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ptgs1P22437 602 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zscan22Q8BGS5 496 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stk38Q91VJ4 465 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PtprmP28828 1452 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myd88P22366 296 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Irf5P56477 497 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CoilQ5SU73 570 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atg3Q9CPX6 314 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Odf2lQ9D478 642 aa11.03□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem67Q8BR76 992 aa11.02□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ApobrQ8VBT6 942 aa11.02□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fndc1E9Q043 1732 aa11.02□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa11.02□□□□□ -0.64
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ano6Q6P9J9 911 aa11.02□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AidaQ8C4Q6 305 aa11.02□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wdr24Q8CFJ9 790 aa11.02□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa11.02□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Agtpbp1Q641K1 1218 aa11.02□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trpm1Q2TV84 1622 aa11.02□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mknk2Q8CDB0 459 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cfap157Q0VFX2 523 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bend3Q6PAL0 825 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rufy2Q8R4C2 606 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Efcab2Q9CQ46 164 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igsf1Q7TQA1 1317 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ets1P27577 440 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stat1P42225 749 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tgfb1i1Q62219 461 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Evc2Q8K1G2 1220 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LratQ9JI60 231 aa11.01□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igflr1Q3U4N7 345 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Washc4Q3UMB9 1173 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ano1Q8BHY3 960 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slain2Q8CI08 581 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gys2Q8VCB3 704 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc7Q9D541 371 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fsd2Q8BZ52 692 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CrklP47941 303 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ercc3P49135 783 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Limch1Q3UH68 1057 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hand2Q61039 217 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slu7Q8BHJ9 585 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Srgap1Q91Z69 1062 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc94Q9D6J3 314 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cwc25Q9DBF7 416 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hmg20bQ9Z104 317 aa11□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NmiO35309 314 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abl1P00520 1123 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ubash3aQ3V3E1 624 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ift57Q8BXG3 429 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wdr17E9Q271 1322 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pdzd9Q9D9M4 266 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Calcoco2A2A6M5 331 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfp251Q6PCX8 632 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Drc7Q6V3W6 876 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa10.99□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bin1O08539 588 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hap1O35668 628 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cd22P35329 862 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc162pQ0VG85 912 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vps54Q5SPW0 977 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Phkg2Q9DB30 406 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Syt10Q9R0N4 523 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm21969J3QJZ1 289 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Leo1Q5XJE5 667 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GptQ8QZR5 496 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ZgpatQ8VDM1 511 aa10.98□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gabpb2P81069 414 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ncoa4Q5U4H9 625 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sgsm2Q80U12 1005 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Otud6bQ8K2H2 294 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf541Q0GGX2 1363 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim34bJ3QNR8 485 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Timm10P62073 90 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cnpy2Q9QXT0 182 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AglF8VPN4 1532 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lekr1B2RVN1 116 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Me3Q8BMF3 604 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krt25Q8VCW2 446 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CemipQ8BI06 1361 aa10.97□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Oas2E9Q9A9 742 aa10.96□□□□□ -0.65
Clstn3-201ENSMUST00000008297 FanccP50652 591 aa10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.2 ms