RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641578.1

CASC19-240, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,061 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-240ENST00000641578 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ENO4A6NNW6 628 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 H3BMH7 237 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CLDN4O14493 209 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ADAMDEC1O15204 470 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ZNF749O43361 778 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SLC28A2O43868 658 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 PCDHGA12O60330 932 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CTNSO60931 367 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 E2F6O75461 281 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 C1QL1O75973 258 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 OR2B3O76000 313 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 MFN2O95140 757 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 LYNP07948 512 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 NR2F1P10589 423 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CD247P20963 164 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CSF2RBP32927 897 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 GALNSP34059 522 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CHN2P52757 468 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 PRKAG1P54619 331 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SLURP1P55000 103 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CASP9P55211 416 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 HSD17B7P56937 341 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 PPP2R2BQ00005 443 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 MAP4K2Q12851 820 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 MERTKQ12866 999 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 LTB4RQ15722 352 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SLC36A3Q495N2 470 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 FHL5Q5TD97 284 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CDC73Q6P1J9 531 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SZRD1Q7Z422 152 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 STK32CQ86UX6 486 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 OR7G2Q8NG99 324 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 PMM1Q92871 262 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 RAB8BQ92930 207 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 GIMAP5Q96F15 307 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 OR7D2Q96RA2 312 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ADI1Q9BV57 179 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 REEP1Q9H902 201 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 GIN1Q9NXP7 522 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SPEGQ15772 3267 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.3□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 TTC36A6NLP5 189 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 A8MVJ9 347 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 FAM227AF5H4B4 570 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 SIGLEC6O43699 453 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 COQ9O75208 318 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 PPM1BO75688 479 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 DNAJB5O75953 348 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CPNE6O95741 557 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 AK1P00568 194 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 OPN1SWP03999 348 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 IFNW1P05000 195 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 GUSBP08236 651 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 THRBP10828 461 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 RHCEP18577 417 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 NT5EP21589 574 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 MYF6P23409 242 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 CAPGP40121 348 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 GRK6P43250 576 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 XCR1P46094 333 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 KCNJ5P48544 419 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 RAD23AP54725 363 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 TMPRSS3P57727 454 aa7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CASC19-240ENST00000641578 MGAT2Q10469 447 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms