RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TYRP1	P17643	537 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GIPR	P48546	466 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAM1	Q15629	374 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	VASN	Q6EMK4	673 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958		Q6ZTK2	550 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	EID2	Q8N6I1	236 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CMTM3	Q96MX0	182 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GULP1	Q9UBP9	304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OR6C75	A6NL08	312 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OR10H3	O60404	316 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	UGDH	O60701	494 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	IGHA1	P01876	353 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ETFA	P13804	333 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	HSD3B1	P14060	373 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PRF1	P14222	555 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	RPA2	P15927	270 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	HSD3B2	P26439	372 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LINGO4	Q6UY18	593 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	DRGX	A6NNA5	263 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	IQCF5	A8MTL0	148 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRTM2	O43300	516 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF749	O43361	778 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	FBP1	P09467	338 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CBSL	P0DN79	551 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CEL	P19835	753 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PAX6	P26367	422 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MST1	P26927	711 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CBS	P35520	551 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CCR9	P51686	369 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	USP53	Q70EK8	1073 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MNT	Q99583	582 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	APOL5	Q9BWW9	433 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CIPC	Q9C0C6	399 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	DISC1	C4P0D8	188 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	UBE2C	O00762	179 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MID1	O15344	667 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GJB3	O75712	270 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CD3G	P09693	182 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	IDS	P22304	550 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	MPG	P29372	298 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LIM2	P55344	173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	AP3S2	P59780	193 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GMFB	P60983	142 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ECH1	Q13011	328 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	GINS1	Q14691	196 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF212	Q495C1	297 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB2	Q8N680	514 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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