RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592561.5

PSMD8-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 8, human

TSL 2

Gene PSMD8, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD8-208	ENST00000592561	MYOT	Q9UBF9	498 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	VPS4A	Q9UN37	437 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DLGAP1	O14490	977 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DPM1	O60762	260 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DRD5	P21918	477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	UQCRC2	P22695	453 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	SOAT1	P35610	550 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CDKN2C	P42773	168 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	MLF1	P58340	268 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DCAF7	P61962	342 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	KCNAB2	Q13303	367 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	MFAP5	Q13361	173 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	USP51	Q70EK9	711 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	GIMAP5	Q96F15	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	VSTM2L	Q96N03	204 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	LMF1	Q96S06	567 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ITPA	Q9BY32	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ABI3	Q9P2A4	366 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	MED13	Q9UHV7	2174 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	FRG2C	A6NGY1	282 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	WWP2	O00308	870 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CXCR6	O00574	342 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	MAN1A2	O60476	641 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ITGA10	O75578	1167 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	OR2J2	O76002	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM87A	P0C7U9	286 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	PTPN6	P29350	595 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	PPIC	P45877	212 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	PRIM2	P49643	509 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	PRKAG1	P54619	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	PSPH	P78330	225 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	IL18R1	Q13478	541 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	GAB1	Q13480	694 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	TP53BP2	Q13625	1128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	DAG1	Q14118	895 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ZBED5	Q49AG3	693 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF605	Q86T29	641 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	BEST3	Q8N1M1	668 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC15A4	Q8N697	577 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	NRBF2	Q96F24	287 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PSMD8-208	ENST00000592561	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms