RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.78■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 PCMT1P22061 227 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 PGDP52209 483 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 ZNF136P52737 540 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 SGCDQ92629 289 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 MUL1Q969V5 352 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 CAPN10Q9HC96 672 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 CLN6Q9NWW5 311 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 U3KQA8 63 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 RP1P56715 2156 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-218ENST00000590546 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 C17orf105B2RV13 164 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PEX12O00623 359 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 DRD5P21918 477 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 TSPAN31Q12999 210 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CASP12Q6UXS9 341 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ISOC1Q96CN7 298 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 Q96MT0 163 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 AASSQ9UDR5 926 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.77■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CLDN24A6NM45 220 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CLCA1A8K7I4 914 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 AHCYL1O43865 530 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 TECTAO75443 2155 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PERM1Q5SV97 790 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 C12orf73Q69YU5 71 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CCDC103Q8IW40 242 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CMIPQ8IY22 773 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 RORBQ92753 470 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ART5Q96L15 291 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 DOK1Q99704 481 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PRR14Q9BWN1 585 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.76■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 HRKO00198 91 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SYPP08247 313 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 TMBIM6P55061 237 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PIGFQ07326 219 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ZNF141Q15928 474 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ZNF559Q9BR84 538 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 COPS4Q9BT78 406 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 LHPPQ9H008 270 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CBLCQ9ULV8 474 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.75■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 OR2W5A6NFC9 320 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CT45A8P0DMV1 189 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CT45A9P0DMV2 189 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ATP12AP54707 1039 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CCL7P80098 99 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 CT45A2Q5DJT8 189 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 GPR107Q5VW38 600 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 EID2Q8N6I1 236 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.74■□□□□ 0.91
USP36-218ENST00000590546 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms