RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561407.1

TMOD2-206, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-206ENST00000561407 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CENPUQ71F23 418 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 KCNMB4Q86W47 210 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 NECAB1Q8N987 351 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 PELI1Q96FA3 418 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 KRT12Q99456 494 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 GSDMCQ9BYG8 508 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 STRADBQ9C0K7 418 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SGK2Q9HBY8 427 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CHST11Q9NPF2 352 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF639Q9UID6 485 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 POMT2Q9UKY4 750 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CDH9Q9ULB4 789 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SLC7A7Q9UM01 511 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 PXDNLA1KZ92 1463 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 C10orf71Q711Q0 1435 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ADCY9O60503 1353 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF831Q5JPB2 1677 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ERVV-2B6SEH9 535 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 H3BQF6 201 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 PDLIM1O00151 329 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 WRBO00258 174 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CLDN5O00501 218 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DFNA5O60443 496 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CTSVO60911 334 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 B3GAT3O94766 335 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DPEP1P16444 411 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 MSH3P20585 1137 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ALDH3B1P43353 468 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DNA2P51530 1060 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 FUT6P51993 359 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 MLLT10P55197 1068 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 BACE1P56817 501 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SLC8A3P57103 927 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DRP2Q13474 957 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 TFDP1Q14186 410 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 GRB14Q14449 540 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 C3AR1Q16581 482 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CALCRLQ16602 461 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 XKR6Q5GH73 641 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 LIPNQ5VXI9 398 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CARD17Q5XLA6 110 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 LRRC31Q6UY01 552 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 C17orf64Q86WR6 236 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 KMT5CQ86Y97 462 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 LRRC8AQ8IWT6 810 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CNBD1Q8NA66 436 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 TCP11Q8WWU5 503 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 MTBPQ96DY7 904 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 C12orf66Q96MD2 445 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 TGM7Q96PF1 710 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 MTMR9Q96QG7 549 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 OR1F2PQ96R84 312 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 OMDQ99983 421 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 CPVLQ9H3G5 476 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 GPR83Q9NYM4 423 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 NLGN3Q9NZ94 848 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SUN2Q9UH99 717 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 MEMO1Q9Y316 297 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 SCN11AQ9UI33 1791 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 DLEC1Q9Y238 1755 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD2-206ENST00000561407 A0A1W2PPI3 338 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms