RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DDI1	Q8WTU0	396 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3R3	Q92569	461 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NRGN	Q92686	78 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	LHX4	Q969G2	390 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35C1	Q96A29	364 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PELI1	Q96FA3	418 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf58	Q96LI9	332 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CYTH2	Q99418	400 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	COPS8	Q99627	209 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NLN	Q9BYT8	704 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	AZI2	Q9H6S1	392 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB18	Q9NP72	206 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF186	Q9NXI6	227 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GNG12	Q9UBI6	72 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSF	Q9UBX1	484 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	STUB1	Q9UNE7	303 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RASD1	Q9Y272	281 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1A2	Q9Y585	309 aa		2.46	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GVL5	298 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf60	A6NFR6	353 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KDELR3	O43731	214 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	HCN1	O60741	890 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR1	O75083	606 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GLRA3	O75311	464 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NOL4	O94818	638 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF19	O95750	216 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHG3	P01860	377 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MB	P02144	154 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-ND2	P03891	347 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TPM3	P06753	285 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTA1	P08263	222 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ACP2	P11117	423 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ETS2	P15036	469 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP11B1	P15538	503 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ACADS	P16219	412 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TNNI1	P19237	187 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBG1	P23258	451 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CD80	P33681	288 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	S100A5	P33763	92 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	AHR	P35869	848 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEA9	P43362	315 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TPMT	P51580	245 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PLP1	P60201	277 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CSNK2B	P67870	215 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	IL9R	Q01113	521 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SRY	Q05066	204 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL16	Q0P5N6	197 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTN1	Q12860	1018 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DLG1	Q12959	904 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	NCF4	Q15080	339 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF13	Q15543	124 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TGFBI	Q15582	683 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	WSCD1	Q658N2	575 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM64	Q6YI46	380 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		2.45	□□□□□ -2.02
AKAP13-223	ENST00000560957	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		2.45	□□□□□ -2.02

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