RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A087WW49	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CLDN5	O00501	218 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CTAGE5	O15320	804 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	TNFSF12	O43508	249 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	KLHL41	O60662	606 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	TOX	O94900	526 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	MBD3	O95983	291 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CSF2	P04141	144 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	UGT2B4	P06133	528 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PRSS1	P07477	247 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CYBA	P13498	195 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CYP2B6	P20813	491 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	TIMP3	P35625	211 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PGF	P49763	221 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PAX9	P55771	341 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	TIMM10	P62072	90 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CCNA1	P78396	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	IFT88	Q13099	833 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	TMED1	Q13445	227 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	PORCN	Q9H237	461 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	MYH7	P12883	1935 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-210	ENST00000556321	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321		H0YL77	283 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF195	O14628	629 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	PCDH7	O60245	1069 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	JAK2	O60674	1132 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	TSC22D2	O75157	780 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CNMD	O75829	334 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	MT-ND1	P03886	318 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CD48	P09326	243 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CEBPB	P17676	345 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	RGS4	P49798	205 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	PPT1	P50897	306 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CRYBA2	P53672	197 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CBX1	P83916	185 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	RBBP4	Q09028	425 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	ZP4	Q12836	540 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	COX10	Q12887	443 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	SELPLG	Q14242	412 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CCL14	Q16627	93 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms