RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550144.1

CTDSP2-206, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 4

Gene CTDSP2, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF527Q8NB42 609 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 DIO2Q92813 273 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 NXPE2Q96DL1 559 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 LMF1Q96S06 567 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF347Q96SE7 839 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 VCX3BQ9H321 246 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 P4HTMQ9NXG6 502 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 FBXL4Q9UKA2 621 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 ABCG2Q9UNQ0 655 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.65□□□□□ -0.7
CTDSP2-206ENST00000550144 SPEGQ15772 3267 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 WWP2O00308 870 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 HS6ST1O60243 411 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NID1P14543 1247 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 HPGDP15428 266 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ABCD3P28288 659 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DCTP40126 519 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 VHLP40337 213 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PNLIPRP2P54317 469 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 FOXC1Q12948 553 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 IL10RAQ13651 578 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 MAPK14Q16539 360 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PDZK1Q5T2W1 519 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 RNF220Q5VTB9 566 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 LPCAT4Q643R3 524 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 MRGPREQ86SM8 312 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CYP4Z1Q86W10 505 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PRR22Q8IZ63 422 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF614Q8N883 585 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CATSPER1Q8NEC5 780 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OR2T29Q8NH02 315 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NRG4Q8WWG1 115 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 EME1Q96AY2 570 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OMA1Q96E52 524 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 IP6K3Q96PC2 410 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ADOQ96SZ5 270 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 UBQLN4Q9NRR5 601 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NDUFAF4Q9P032 175 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 MYOTQ9UBF9 498 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 IL17BQ9UHF5 180 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TRABD2BA6NFA1 517 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PRAMEF25A6NGN4 478 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NPIPB9F8W1W9 429 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 M0R3H8 397 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 SCDO00767 359 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TSPAN2O60636 221 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DPM1O60762 260 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 ABCB7O75027 752 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 E2F6O75461 281 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DNAJB5O75953 348 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DIRAS1O95057 198 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PRSS23O95084 383 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 UTS2O95399 124 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 EPPINO95925 133 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CYP4B1P13584 511 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NAGAP17050 411 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 RHCEP18577 417 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PEX2P28328 305 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 EFR3AQ14156 821 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TGIF1Q15583 401 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 NRF1Q16656 503 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 GRAMD1BQ3KR37 738 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TCTN3Q6NUS6 607 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 DEF8Q6ZN54 512 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 COMTD1Q86VU5 262 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CMIPQ8IY22 773 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 CLIP4Q8N3C7 705 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 OR4C3Q8NH37 302 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-206ENST00000550144 PIP5K1AQ99755 562 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms