RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 TPRA1Q86W33 373 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 FAM228AQ86W67 206 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 NUDT13Q86X67 352 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 SLC43A2Q8N370 569 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 SFRP1Q8N474 314 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CEP112Q8N8E3 955 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 BANPQ8N9N5 519 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 RAET1EQ8TD07 263 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MAPK15Q8TD08 544 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 DNAJB3Q8WWF6 145 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 HTRA1Q92743 480 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ZIM3Q96PE6 472 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC77Q9BR77 488 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 BCL2L14Q9BZR8 327 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 LHX5Q9H2C1 402 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 NUDT15Q9NV35 164 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 COX16Q9P0S2 106 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CD300AQ9UGN4 299 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 SNX12Q9UMY4 172 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 STK38LQ9Y2H1 464 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 GRIN2DO15399 1336 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.14□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM120BA0PK00 339 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 FUOMA2VDF0 154 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 A4D1N5 150 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MTMR11A4FU01 709 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 A8MXE2 369 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 PTGESO14684 152 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MED7O43513 233 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 SSX5O60225 188 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 GPX5O75715 221 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 GAS8O95995 478 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 COX5BP10606 129 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ABCD3P28288 659 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ACADLP28330 430 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 HLA-FP30511 346 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ETV5P41161 510 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 NSFP46459 744 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 LYZP61626 148 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 TNNC1P63316 161 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 C2orf54Q08AI8 447 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ELP6Q0PNE2 266 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 PTGISQ16647 500 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 THEM4Q5T1C6 240 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM270Q6UE05 265 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 C4orf22Q6V702 233 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 NT5DC3Q86UY8 548 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 UNC93AQ86WB7 457 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 LRRC39Q96DD0 335 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 MTERF3Q96E29 417 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 HPDLQ96IR7 371 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 CPB2Q96IY4 423 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 VPS35Q96QK1 796 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-210ENST00000549306 PCDHB18PQ96TA0 734 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms