RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CENPUQ71F23 418 aa3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 PRELID2Q8N945 189 aa3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.89□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 CD200R1Q8TD46 325 aa3.89□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.89□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.89□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.88□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.88□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 AAGABQ6PD74 315 aa3.88□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.88□□□□□ -1.79
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