RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511978.5

MATR3-218, Transcript of matrin 3, human

TSL 3

Gene MATR3, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-218	ENST00000511978	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	BMPR1B	O00238	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RAD51C	O43502	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TNFSF15	O95150	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ITIH1	P19827	911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	2e-6	■■■■□ 24.4
MATR3-218	ENST00000511978	IVD	P26440	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GCH1	P30793	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AHR	P35869	848 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LIMK2	P53671	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GFER	P55789	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PPP1CA	P62136	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RPA4	Q13156	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TMED2	Q15363	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ELMO1	Q92556	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DDO	Q99489	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PISD	Q9UG56	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RP1	P56715	2156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978		A8MU76	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CTDSP2	O14595	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NDC80	O14777	642 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PFDN6	O15212	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	C9	P02748	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	APOA4	P06727	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF23	P17027	643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PDHA2	P29803	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CCR7	P32248	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ETV5	P41161	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ELK3	P41970	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC1A2	P43004	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CD151	P48509	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CD81	P60033	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	KRT33B	Q14525	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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