RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SDHD	O14521	159 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	HDAC3	O15379	428 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SOX30	O94993	753 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CRH	P06850	196 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	G6PD	P11413	515 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CD1E	P15812	388 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF708	P17019	499 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	HPCAL1	P37235	193 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	LHX2	P50458	406 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DGKQ	P52824	942 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GAS1	P54826	345 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DIO3	P55073	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DCST1	Q5T197	706 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OR2A2	Q6IF42	318 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NTM	Q9P121	344 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	HCRTR2	O43614	444 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FADS1	O60427	444 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CTAG2	O75638	210 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KIT	P10721	976 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PCYT1A	P49585	367 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	C21orf58	P58505	322 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PRR5	P85299	388 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	HSPB3	Q12988	150 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MLC1	Q15049	377 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TESK1	Q15569	626 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OGFOD2	Q6N063	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MAVS	Q7Z434	540 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NUDT8	Q8WV74	236 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM221A	A4D161	298 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	CLCA1	A8K7I4	914 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF195	O14628	629 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	SCO2	O43819	266 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	ZIC3	O60481	467 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	NKX2-2	O95096	273 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	NGFR	P08138	427 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	LAMP1	P11279	417 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	LBP	P18428	481 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	GABRA3	P34903	492 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	CLDN8	P56748	225 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	CLDN18	P56856	261 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	NUP43	Q8NFH3	380 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	C7orf26	Q96N11	449 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ABCC3-208	ENST00000506464	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64

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