RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 GRAMD1BQ3KR37 738 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 COQ5Q5HYK3 327 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 GCNT6Q5T4J0 391 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC30A6Q6NXT4 461 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 OLIG3Q7RTU3 272 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TREML1Q86YW5 311 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 DPP10Q8N608 796 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 GATSQ8NAP1 163 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 CPT1CQ8TCG5 803 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MIPOL1Q8TD10 442 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 GRHL3Q8TE85 626 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 CGREF1Q99674 301 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MYLK2Q9H1R3 596 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 UBQLN4Q9NRR5 601 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MKLN1Q9UL63 735 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 LIPT1Q9Y234 373 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR45Q9Y484 360 aa12.27□□□□□ -0.45
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PGGT1B-204ENST00000503638 PINLYPA6NC86 204 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 NPIPA5E9PKD4 350 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BNH8 94 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
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PGGT1B-204ENST00000503638 BCHEP06276 602 aa12.26□□□□□ -0.45
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PGGT1B-204ENST00000503638 GNA13Q14344 377 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 RGNQ15493 299 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SYPL1Q16563 259 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa12.26□□□□□ -0.45
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PGGT1B-204ENST00000503638 DLEU7Q6UYE1 221 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 HMGN2P46Q86SG4 172 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ZAR1Q86SH2 424 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MARCH3Q86UD3 253 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC22A16Q86VW1 577 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 LURAP1LQ8IV03 231 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MSRB3Q8IXL7 192 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKFN1Q8N957 763 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 POGLUT1Q8NBL1 392 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC58Q96CX6 371 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 FRMD6Q96NE9 622 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD27Q96NW4 1050 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TAAR6Q96RI8 345 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SDF2Q99470 211 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SH3GL1Q99961 368 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ANGPTL4Q9BY76 406 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 HOXD1Q9GZZ0 328 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 PIF1Q9H611 641 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 EXO5Q9H790 373 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 EFCAB1Q9HAE3 211 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SDHAF3Q9NRP4 125 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ASF1BQ9NVP2 202 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 NPIPA1Q9UND3 350 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCG2Q9UNQ0 655 aa12.26□□□□□ -0.45
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PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFB5O43674 189 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 H6PDO95479 791 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 GDF1P27539 372 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGEA8P43361 318 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TLE1Q04724 770 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 FADDQ13158 208 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SNTA1Q13424 505 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 RUNDC3AQ59EK9 446 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4K17Q8NGC6 315 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1J4Q8NGS1 313 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4C3Q8NH37 302 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM110BQ8TC76 370 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 MAL2Q969L2 176 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ECSITQ9BQ95 431 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TTTY12Q9BZ98 90 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 IKZF5Q9H5V7 419 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SH2D2AQ9NP31 389 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFP64Q9NPA5 681 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 L3MBTL1Q9Y468 752 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 WIF1Q9Y5W5 379 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD33BA6NCL7 494 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 FCMRO60667 390 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP7B1O75881 506 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE9AO76083 593 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ANGPTL1O95841 491 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 NPPAP01160 153 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TBXA2RP21731 343 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-204ENST00000503638 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
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