RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF233	A6NK53	670 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR6C75	A6NL08	312 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NMT2	O60551	498 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RPA2	P15927	270 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	P2RY2	P41231	377 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ITGA9	Q13797	1035 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BEND3	Q5T5X7	828 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MON1B	Q7L1V2	547 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR2L3	Q8NG85	312 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NELFB	Q8WX92	580 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ULK4	Q96C45	1275 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TTC25	Q96NG3	672 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NEK6	Q9HC98	313 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GID8	Q9NWU2	228 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IL20	Q9NYY1	176 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TIMM22	Q9Y584	194 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ABCC12	Q96J65	1359 aa		2.59	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		H3BMM5	538 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		H3BTX0	84 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SCN2B	O60939	215 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP5H	O75947	161 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RGS11	O94810	467 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KRT75	O95678	551 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CYP1A2	P05177	515 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ADRB1	P08588	477 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	STAG3L3	P0CL85	134 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CPA3	P15088	417 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LAP3	P28838	519 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SYK	P43405	635 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	AVPR1B	P47901	424 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NDUFA8	P51970	172 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BCL2A1	Q16548	175 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PSG3	Q16557	428 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FUT10	Q6P4F1	479 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CACUL1	Q86Y37	369 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IQCK	Q8N0W5	287 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MREG	Q8N565	214 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FNDC8	Q8TC99	324 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TFAP2B	Q92481	460 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	THRSP	Q92748	146 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GKN1	Q9NS71	199 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KAT6A	Q92794	2004 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		A6NNC1	897 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	STMND1	H3BQB6	276 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HIP1	O00291	1037 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FBP2	O00757	339 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SERPINB7	O75635	380 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ERVK-10	P10266	1014 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PAX1	P15863	534 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BDKRB2	P30411	391 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HMOX2	P30519	316 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NDST2	P52849	883 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ART1	P52961	327 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	P2RX3	P56373	397 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MAP3K7CL	P57077	242 aa		2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2

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