RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 MFN2O95140 757 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 STAMBPO95630 424 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 F10P00742 488 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SERPINA1P01009 418 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ATP12AP54707 1039 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 EFR3AQ14156 821 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 NTRK2Q16620 822 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 VRK2Q86Y07 508 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SMYD1Q8NB12 490 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 HGDQ93099 445 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 LRGUKQ96M69 825 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.19■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 LCN1P31025 176 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CXADRP78310 365 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 PMM1Q92871 262 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 NODALQ96S42 347 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 HPF1Q9NWY4 346 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ABI3Q9P2A4 366 aa15.18■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CLDN24A6NM45 220 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TPST1O60507 370 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CEACAM4O75871 244 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF682O95780 498 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 WDPCPO95876 746 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 IL7RP16871 459 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TBXA2RP21731 343 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 HLCSP50747 726 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF141Q15928 474 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 DUSP7Q16829 419 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 APOOLQ6UXV4 268 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF614Q8N883 585 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TMCO6Q96DC7 493 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 HOXD1Q9GZZ0 328 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 V9GYQ6 96 aa15.17■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 IFNA14P01570 189 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 HPGDP15428 266 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CD96P40200 585 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CYB561P49447 251 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 MFAP5Q13361 173 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TUBA3CQ13748 450 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 KLHL26Q53HC5 615 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 BORAQ6PGQ7 559 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CBLL1Q75N03 491 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SPATA24Q86W54 205 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 OR52E4Q8NGH9 312 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 GRHL3Q8TE85 626 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TTC9Q92623 222 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TPD52L3Q96J77 140 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TRIM15Q9C019 465 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF232Q9UNY5 417 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 IFT52Q9Y366 437 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TCRBV5S2A0A599 114 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 SCDO00767 359 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TP53I11O14683 189 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 FADS1O60427 444 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 NID1P14543 1247 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CD247P20963 164 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 EVI2BP34910 448 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 CCNIQ14094 377 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 TBR1Q16650 682 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 BICRALQ6AI39 1079 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.16■□□□□ 0.02
THBS3-207ENST00000486260 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms