RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PRODH2Q9UF12 536 aa11.45□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 CCT7Q99832 543 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 ENPP6Q6UWR7 440 aa11.43□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 RNF138Q8WVD3 245 aa11.43□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 SFXN2Q96NB2 322 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TM9SF2Q99805 663 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 YIPF4Q9BSR8 244 aa11.43□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 DKKL1Q9UK85 242 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SH3D21A4FU49 640 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 E9PBE3 544 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 RGS14O43566 566 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PEX11AO75192 247 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TNFSF13O75888 250 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 HRGP04196 525 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ZNF708P17019 499 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 LBPP18428 481 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PRPH2P23942 346 aa11.42□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.586e-12■■■■■ 39.4
PRAME-212ENST00000485532 GCKP35557 465 aa11.42□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 C2orf80Q0P641 193 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 STX5Q13190 355 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 KEAP1Q14145 624 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 IMPG1Q17R60 797 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GALNTL6Q49A17 601 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SPIN4Q56A73 249 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 C6orf136Q5SQH8 315 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 NXNQ6DKJ4 435 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 OGFOD2Q6N063 350 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 UBQLNLQ8IYU4 475 aa11.42□□□□□ -0.58
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