RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ELP4Q96EB1 424 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NLGN3Q9NZ94 848 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CDHR4A6H8M9 788 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 K7EQS6 105 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRPO00591 440 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG13O75143 517 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RRASP10301 218 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FUT1P19526 365 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DMC1Q14565 340 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PGGHGQ32M88 737 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM220Q6QAJ8 160 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KLBQ86Z14 1044 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 INSL6Q9Y581 213 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM30A4D0T7 59 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SHISA7A6NL88 538 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR171O14626 319 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FABP7O15540 132 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GMDSO60547 372 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 YES1P07947 543 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NMBP08949 121 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 H2AFB1P0C5Y9 115 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TYRP14679 529 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR1FP30939 366 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MXD1Q05195 221 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RPA4Q13156 261 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX261Q6UWH6 196 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 USP30Q70CQ3 517 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC34A3Q8N130 599 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NATD1Q8N6N6 113 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM52Q8NDY8 209 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PELI1Q96FA3 418 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX101Q9BY14 249 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SHARPINQ9H0F6 387 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MED9Q9NWA0 146 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 U3KQ87 197 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMLR1H3BR10 107 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SOCS6O14544 535 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF749O43361 778 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SYPP08247 313 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IRF1P10914 325 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UBL4AP11441 157 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAR1BP31321 381 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ESCO2Q56NI9 601 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 USP34Q70CQ2 3546 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.37□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 IQCHQ86VS3 1027 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35A4Q96G79 324 aa3.37□□□□□ -1.87
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PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TPOP07202 933 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 F3P13726 295 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CELP19835 753 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SDHBP21912 280 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD10P28358 340 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IL10RAQ13651 578 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GSG1Q2KHT4 349 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SHFQ7M4L6 423 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMIEQ8NEW7 156 aa3.37□□□□□ -1.87
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