RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIGD4Q8IY51 512 aa-1.67□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01560Q8TB33 94 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR148Q8TDV2 347 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCANP1Q8TF63 244 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB7BQ96AH8 199 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDCCAG3Q96C92 435 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAMK2N2Q96S95 79 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOXF2Q9BQY4 288 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOL6Q9BWW8 343 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM7Q9C029 511 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBA4BQ9H853 241 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF121Q9H920 327 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAG1Q9NWQ8 432 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOK5Q9P104 306 aa-1.67□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKUB1A6NFN9 424 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASTOR2A6NHX0 329 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPIPA2E9PIF3 369 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPIPA3F8WFD2 350 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MANBAO00462 879 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYNGR2O43760 224 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX3O60493 162 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CABYRO75952 493 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOBTB1O94844 696 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNAPINO95295 136 aa-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC4A1P02730 911 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDGFRBP09619 1106 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBXA2RP21731 343 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 VDAC1P21796 283 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RAP1AP62834 184 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL5RAQ01344 420 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 MORC3Q14149 939 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRD3Q15059 726 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CST6Q15828 149 aa-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SCXQ7RTU7 201 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPH2Q8IWU9 490 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SKA3Q8IX90 412 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF679Q8IYX0 411 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF439Q8NDP4 499 aa-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RFESDQ8TAC1 157 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTL9Q8TC94 416 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHYHIPQ92561 330 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GAD1Q99259 594 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TM2D1Q9BX74 207 aa-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PLGRKTQ9HBL7 147 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMG20AQ9NP66 347 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAS2R14Q9NYV8 317 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 VPS18Q9P253 973 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC17A7Q9P2U7 560 aa-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPN13Q12923 2485 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CCSO14618 274 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCK2O43639 380 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFS3O75489 264 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 GBAP04062 536 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR56A5P0C7T3 313 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPT2P23786 658 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-172P-201ENST00000411000 CST5P28325 142 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
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