RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 ACOX3O15254 700 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 FRS3O43559 492 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NADKO95544 446 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 WT1P19544 449 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PLAURQ03405 335 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PLCXD2Q0VAA5 305 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D25Q3MII6 688 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZNF836Q6ZNA1 936 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NXPE2Q96DL1 559 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZNF354BQ96LW1 612 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa21.44■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 M0R3H8 397 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 TSPAN2O60636 221 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 SEMA7AO75326 666 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 OR2J2O76002 312 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LGI1O95970 557 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 HPP00738 406 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 GUSBP08236 651 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 DCTP40126 519 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 YAP1P46937 504 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 OR5L2Q8NGL0 311 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PROX1Q92786 737 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PINK1Q9BXM7 581 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NDUFAF4Q9P032 175 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 FUT4P22083 530 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 SLC34A3Q8N130 599 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZNF614Q8N883 585 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 IFT52Q9Y366 437 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa21.43■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ABCB7O75027 752 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 UGT2B11O75310 529 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 FABP3P05413 133 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 DBIP07108 87 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 FASP25445 335 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PRKAR1BP31321 381 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CLN3Q13286 438 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 APOOLQ6UXV4 268 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CARM1Q86X55 608 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 RAB43Q86YS6 212 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ARSGQ96EG1 525 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PRR14Q9BWN1 585 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 YY1AP1Q9H869 796 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NTN4Q9HB63 628 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa21.42■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 J3KTA2 159 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ICOSLGO75144 302 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 UTS2O95399 124 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CYP4B1P13584 511 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NID1P14543 1247 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ATP12AP54707 1039 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZNF141Q15928 474 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 GRAMD1BQ3KR37 738 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CLOCKO15516 846 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CST1P01037 141 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 THBS1P07996 1170 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 IL12BP29460 328 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 IST1P53990 364 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 HOXC5Q00444 222 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 ATP6AP1Q15904 470 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LRRC36Q1X8D7 754 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LPCAT4Q643R3 524 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 OR6T1Q8NGN1 323 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 OR5M3Q8NGP4 307 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PMM1Q92871 262 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 RTN4RQ9BZR6 473 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 VNN3Q9NY84 501 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa21.41■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 TPST2O60704 377 aa21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NRG3P56975 720 aa21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 FBXW4P57775 412 aa21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NPTX1Q15818 432 aa21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 KLHL26Q53HC5 615 aa21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LYPD8Q6UX82 237 aa21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 RASL10BQ96S79 203 aa21.4■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NKX2-8O15522 239 aa21.39■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LDLRP01130 860 aa21.39■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 NRF1Q16656 503 aa21.39■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LIN52Q52LA3 116 aa21.39■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 CDCP1Q9H5V8 836 aa21.39■■□□□ 1.02
CNN3-202ENST00000394202 UBQLN4Q9NRR5 601 aa21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms