RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SLC26A3P40879 764 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 P2RX3P56373 397 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FBXW4P57775 412 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PPIAP62937 165 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GNA12Q03113 381 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TGIF1Q15583 401 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM119Q4V9L6 283 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GPAT3Q53EU6 434 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AGKQ53H12 422 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TEX44Q53QW1 395 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MOB1BQ7L9L4 216 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SSX6Q7RTT6 188 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CLNKQ7Z7G1 428 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PARGQ86W56 976 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR4K14Q8NGD5 310 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 UBA3Q8TBC4 463 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NANPQ8TBE9 248 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEC3Q8TD91 643 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MAFIPQ8WZ33 124 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD7Q92527 254 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TM4SF19Q96DZ7 209 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LURAP1Q96LR2 239 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 WDR76Q9H967 626 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SEC61A2Q9H9S3 476 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SCN3BQ9NY72 215 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD9Q9P000 198 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NTMQ9P121 344 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PISDQ9UG56 409 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RTTNQ86VV8 2226 aa2.3□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RFX7Q2KHR2 1363 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GAKO14976 1311 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF521Q96K83 1311 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF532Q9HCE3 1301 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DPPA5A6NC42 116 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PFDN6O15212 129 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZW10O43264 779 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ACSL3O95573 720 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINA1P01009 418 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CREB1P16220 341 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AKR1C4P17516 323 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 S100A1P23297 94 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PPP2R1BP30154 601 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNA5P30532 468 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PKLRP30613 574 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB5P36952 375 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRCPP42785 496 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RGS4P49798 205 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCT8P50990 548 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BRWD1-AS2P59051 145 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 WDR5P61964 334 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RPP38P78345 283 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FOLH1Q04609 750 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 STX4Q12846 297 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 POU2AF1Q16633 256 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TCTN1Q2MV58 587 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CDKL4Q5MAI5 379 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RABGAP1LQ5R372 815 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LPCAT4Q643R3 524 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 EFCAB12Q6NXP0 572 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TPGS1Q6ZTW0 290 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM26Q6ZUK4 368 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD46Q86W74 232 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PLD3Q8IV08 490 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KBTBD3Q8NAB2 608 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NTNG2Q96CW9 530 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CBWD1Q9BRT8 395 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-6Q9BXR3 956 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DNTTIP1Q9H147 329 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BFARQ9NZS9 450 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 STK39Q9UEW8 545 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-19Q9WJR5 959 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MYO7AQ13402 2215 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JND7 137 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 M0R036 132 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 VCYO14598 125 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms