RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ABCG2Q9UNQ0 655 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ERICH4A6NGS2 130 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CXCR6O00574 342 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 F10P00742 488 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NGFRP08138 427 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 GGT1P19440 569 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 TBXA2RP21731 343 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 GRAMD1BQ3KR37 738 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 DESI1Q6ICB0 168 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 PGM2L1Q6PCE3 622 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC80Q76M96 950 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 PAQR8Q8TEZ7 354 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 FIG4Q92562 907 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 MUC13Q9H3R2 512 aa25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINB7O75635 380 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 OR1C1Q15619 314 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SLC22A10Q63ZE4 541 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 OR4C3Q8NH37 302 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CNIH4Q9P003 139 aa25.5■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NPIPA7E9PJI5 369 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NPIPB9F8W1W9 429 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SCDO00767 359 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 UGT2B17O75795 530 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NPIPA8P0DM63 369 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 EVI2BP34910 448 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CLK3P49761 638 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF141Q15928 474 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM81Q6P7N7 255 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 IGFL3Q6UXB1 125 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NODALQ96S42 347 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SH2D2AQ9NP31 389 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 IFT52Q9Y366 437 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SNX13Q9Y5W8 968 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 AGAP5A6NIR3 686 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NEURL1O76050 574 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 DBIP07108 87 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 RHDQ02161 417 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 GLYATQ6IB77 296 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ZADH2Q8N4Q0 377 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ASB9Q96DX5 294 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ABHD17AQ96GS6 310 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 METTL7AQ9H8H3 244 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 FLRT3Q9NZU0 649 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 TUBD1Q9UJT1 453 aa25.49■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 MGAQ8IWI9 3026 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 IFNA14P01570 189 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 IL7RP16871 459 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 KDELR2P33947 212 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SPINK14Q6IE38 97 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF614Q8N883 585 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 PSD4Q8NDX1 1056 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ZG16BQ96DA0 208 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHAC1Q9H158 963 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SACM1LQ9NTJ5 587 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 KLRF1Q9NZS2 232 aa25.48■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF25A6NGN4 478 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 FADS1O60427 444 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A12O75746 678 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 STAMBPO95630 424 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 P04436 131 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 NCK1P16333 377 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 KCNAB2Q13303 367 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SNTA1Q13424 505 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ST3GAL2Q16842 350 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00303Q3SY05 128 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 PDZK1Q5T2W1 519 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 C19orf48Q6RUI8 117 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 MDGA2Q7Z553 956 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF227Q86WZ6 799 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 POGLUT1Q8NBL1 392 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 OR52P1PQ8NH57 321 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SLC26A7Q8TE54 656 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 GRHL3Q8TE85 626 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 RNF138Q8WVD3 245 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 SEC14L3Q9UDX4 400 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 KCNE5Q9UJ90 142 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF232Q9UNY5 417 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 DTNAQ9Y4J8 743 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQD3 144 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 ALG1L2C9J202 215 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 M0QX08 132 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-201ENST00000345425 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms