RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 CDS1Q92903 461 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 FOXJ1Q92949 421 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 TLCD1Q96CP7 247 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 OPA3Q9H6K4 179 aa9.99□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 TSPEARQ8WU66 669 aa9.99□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 EMC10Q5UCC4 262 aa9.99□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 CD320Q9NPF0 282 aa9.98□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 SIX4Q9UIU6 781 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 C3P01024 1663 aa9.98□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 PTGER4P35408 488 aa9.98□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.98□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 ST7LQ8TDW4 575 aa9.98□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 RAB7BQ96AH8 199 aa9.98□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF778Q96MU6 729 aa9.98□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 TAAR8Q969N4 342 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 APOOQ9BUR5 198 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 POLHQ9Y253 713 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 BET1O15155 118 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 GABRA5P31644 462 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
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