RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPP4P27487 766 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCKP35557 465 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOAT1P35610 550 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR3DL1P43629 444 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHC1P78364 1004 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNJQ5T5M9 372 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 LILRB4Q8NHJ6 448 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTNBP1Q96EV8 351 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3GL2Q99962 352 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD2Q9BX70 525 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTRT3Q9BYD9 372 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGUQ9H490 435 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDHAF3Q9NRP4 125 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIN1Q9NXP7 522 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED11Q9P086 117 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOCK7Q96N67 2140 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX2-6A6NCS4 301 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG1L2C9J202 215 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO1B7G3V0H7 640 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZIC3O60481 467 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOXO94900 526 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL1O95841 491 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLK3P49761 638 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GALT5-AS1P59052 145 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPANXN4Q5MJ08 99 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDXQ7Z353 690 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD46Q86W74 232 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C3Q8NH37 302 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP19Q8WTR2 217 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHMP6Q96FZ7 201 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX37Q96LM6 180 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFXN2Q96NB2 322 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCK2Q9BZX2 261 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERHL2Q9H4I8 314 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 E9PBE3 544 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPPINO95925 133 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT16P08779 473 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPN1P15169 458 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBXA2RP21731 343 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCN1P31025 176 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 NME5P56597 212 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 UFM1P61960 85 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFF3Q07654 80 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPY19L1Q2PZI1 675 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA19Q7Z5L4 167 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 LACC1Q8IV20 430 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC4FQ8N1N0 589 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACBD4Q8NC06 268 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAXEQ8NCW5 288 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4A15Q8NGL6 344 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS15Q8TE58 950 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 VIPAS39Q9H9C1 493 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR45Q9Y5Y3 372 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNE3Q9Y6H6 103 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX15Q9BXT5 2789 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9JVG2 144 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF195O14628 629 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRF1P14222 555 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX6B1P14854 86 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARP49675 285 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHX2P50458 406 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS26P62854 115 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GANABQ14697 944 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCST2Q5T1A1 773 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 AAGABQ6PD74 315 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENPP6Q6UWR7 440 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIX1LQ8IVB5 337 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNIP2Q8NFZ5 429 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR7D2Q96RA2 312 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 G6PC3Q9BUM1 346 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD8B2A6NJW9 211 aa17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms